Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms