Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms