Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBRP36941 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBRP36941 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms