Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms