Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 CENPS-201ENST00000309048 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AL732372.2-201ENST00000431321 437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG3P32926 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AP002852.2-201ENST00000519630 740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AL157902.2-201ENST00000623435 1492 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG3P32926 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG3P32926 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG3P32926 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG3P32926 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG3P32926 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG3P32926 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG3P32926 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms