Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms