Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO2P25791 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO2P25791 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO2P25791 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO2P25791 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms