Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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