Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms