Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFTRP13569 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFTRP13569 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFTRP13569 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms