Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms