Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHAP12694 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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