Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODC1P11926 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODC1P11926 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODC1P11926 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms