Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD28P10747 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD28P10747 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD28P10747 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms