Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC4A1P02730 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.8 ms