Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEC22BO75396 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEC22BO75396 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEC22BO75396 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEC22BO75396 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEC22BO75396 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEC22BO75396 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEC22BO75396 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms