Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms