Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

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Length 811 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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