Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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