Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms