Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSDA5PKW4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms