Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C9orf170A2RU37 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms