Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms