Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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SH3BP1Q9Y3L3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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