Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms