Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms