Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRDM12Q9H4Q4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms