Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms