Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms