Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms