Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FYCO1Q9BQS8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms