Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD1AQ96CP6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms