Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms