Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms