Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4BQ8IWT1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN4BQ8IWT1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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