Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms