Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASSF3Q86WH2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms