Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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