Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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