Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms