Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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