Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms