Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms