Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
WDR44Q5JSH3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR44Q5JSH3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms