Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPIN4Q56A73 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPIN4Q56A73 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPIN4Q56A73 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPIN4Q56A73 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms