Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms