Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
KRTAP24-1Q3LI83 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP24-1Q3LI83 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP24-1Q3LI83 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP24-1Q3LI83 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP24-1Q3LI83 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP24-1Q3LI83 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP24-1Q3LI83 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP24-1Q3LI83 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms