Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms