Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms