Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC57Q2TAC2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms